Ez a 20xx-es év. A földet olyan szörnyek támadták meg, akik az “emberiség ellenségeként” váltak ismertté. annak érdekében, hogy kezelni tudják ezt a veszélyt, speciális képességekkel rendelkező tizenéveseket képző iskolák jöttek létre. Ezeknek az embereknek, akik “tehetségként” váltak ismertté, olyan képességeik voltak, amik dacolhattak a valóság szabályaival. Ezek a természetfeletti erővel rendelkező emberek között volt egy kívülálló, egy egyén, akit elküldtött az egyik ilyen iskola annak ellenére, hogy nincs veleszületett különleges képessége. Ez a főhősünk története, aki egyedül intelligencia és manipuláció segítségével próbálja legyőzni az emberiség ellenségeit.

A Fantazy középpontjában Makoto Misumi áll, egy közönséges középiskolás fiú, akit bátor harcosként egy alternatív világba hívnak. Sajnos a világ istennője megvetéssel mondta: "Csúnya az arcod", megfosztotta tőle a címet, és a pusztaság legkülső peremére száműzte. A pusztában vándorlás közben Makoto sárkányokkal, pókokkal, orkokkal, törpékkel és mindenféle más, nem emberi fajokkal találkozott. Mivel a környezet különbözik saját világától, Makoto most rendkívüli erőket mutat be a varázslatban és a harcban. Így túléli ezt a világot, miközben különféle találkozásokkal foglalkozik. A függöny az alternatív világ társadalmi reform-fantáziáján emelkedik egy fiúról, akit elhagynak az istenek és az emberek.

Ezen anime hősének nem szokványos reinkarnációban van része, ugyanis kardként születik újjá egy fantasy világban, ahol utazását egy vadállatokkal teli erdő közepén kezdi, hol egy sebesült lányba botlik, aki kétségbeesetten menekül az életéért. Miután megmenti őt főszereplőnk, a lány Fran néven mutatkozik be, akinek mint kiderül, fájdalmas múltja van, ugyanis törzsét, a Fekete Macskákat rabszolgasorba taszították és kemény bántalmazásnak volt kitéve. Főszereplőnk valahogy nem bír emlékezni előző életéből a nevére, majd Fran a “Shishou”, azaz Mester nevet adja neki, és ő lesz a használója. Majd Shishou és Fran félelmetes csapattá válván útnak indulnak, hogy igazságot szolgáltassanak az elnyomókkal szemben.