Los Angeles városa két csoportra szakadva próbálja túlélni a nehéz időket. Van, aki megalkudva próbálja átvészelni a nehéz napokat és van, aki lázad az elnyomó hatalmakkal szemben. Míg egyesek megpróbálnak hasznot húzni az új helyzetből elfogadva a földönkívüliek által diktált új világrendet, mások lázadásra kényszerülnek. A volt FBI ügynök Will Bowman és felesége, Katie együtt próbálnak küzdeni a szabadságukért és harcolni a tőlük elszakított fiúk visszaszerzéséért. Mindeközben komoly kihívásokkal és döntésekkel kell szembenézniük.

A Bosszúállókból már jól ismert Coulson (Clark Gregg) a SHIELD (Stratégiai Honvédő Iroda Elhárító és Logisztikai Divíziója) nevű terrorizmus-elhárító szervezet munkatársaként egy különleges osztagot vezet. A csoport tagjai: egy kém, egy pilóta, egy mérnök, egy biokémius, valamint egy hacker. Feladatuk: kivizsgálni az új, különös vagy épp ismeretlen jelenségeket szerte a világon, így védelmezve az emberiséget.