Az előző rész zárásával kezdődnek az események. Sarah helyett Emily Blake, a női bérgyilkos foglalt helyet a szobában, de mielőtt Michaelt lelőtte volna, Van Gogh közbelép, mert neki már nem tetszenek Poseidon tettei és válaszokat akar. Emily némi habozás után őt lövi meg, Michaelék elmenekülnek majd Lincet kórházba viszik, Mike-ot viszont Jacob elrabolja. A sorozat kezdetén Michael levelet küldött T-Bagnek, mert csak ő róla nem gondolta Jacob, hogy segítene neki. Emiatt neki kell megölnie a férfit. Később Linc elhagyja a kórházat és Van Gogh-ról kiderül, hogy él, de épp állapota kritikus. Linc sérülten elmegy Luca-hoz a rendőrökkel együtt és elkapják. A kórházban Sarah a bérgyilkos segítségét kéri aki megadja neki hol van a Mike, majd kéri hogy segítse át a halálba. A fiút megtalálják Jacob egyik informatikusánál akit Linc segítségével elkapnak. Michael bejut Jacob titkos irodájába és elvesz egy merevlemezt, majd találkozik vele és cserét ajánl: a merevlemez Mike-ért. Michael lefegyverezi Jacobot, de Emily színre lép. Megjelenik Whip és T-Bag is, de Whip-et a nő megöli. Közben Jacob ráhívja az FBI-t is a csapatra. Ezután Michael kénytelen átadni a merevlemezt, és elvezeti a tárgy rejtekhelyére. T-Bag lefegyverezi fia gyilkosát és eltöri a nyakát, miközben megjelenik az FBI és T-Bag-et letartóztatják. Michael közben hívást kap, hogy a fia biztonságban van, így nincs értelme átadni a merevlemezt, ezután menekülésre kényszerül. Jacob lelövi a férfit, de kiderül ez a végső nagy terv része volt: Whip és apja korábban egy férfihez mentek akit Michael egyszer régen kiszabadított képessége miatt, és aki élethű másolatokat tud megépíteni szinte bármiről, akár képről, videóról. Ezt felhasználva a Jacob által elkövetett gyilkosságot újra kreálva megépíti a helyszín mását és Michael is beköltözik a megölt CIA-os helyettesnek. A fegyverben vaktöltények voltak így Michael sértetlen marad. Az így készült bizonyítékot felhasználják miután Michaelt és Jacobot elfogják. Michaelt felmentik és visszakapja régi életét. Ő, Sarah, a fiuk, valamit Linc és Sheba együtt vannak. Michaelnek felajánlja az CIA, hogy dolgozzon nekik, de ő inkább a szabad életet választja. A záróképeken Jacobot látjuk a Fox Riverben akinek a cellatársa T-Bag lett, és aki azonnal elkezdi a férfi terrorizálását.